MTEntries category="hoge AND hoge2" で今までは「hogeとhoge2の記事を表示する」という解釈でだったと思うのだけど、MT3.3になって変わったようですね。MT3.3だと記事が表示されなくなっちゃいました。

MTEntries category="hoge OR hoge2"

と記述することで解決。

アークウェブさんの記事に分かりやすく書いてあります。

[Movable TypeのCMS的活用] バージョン3.3で強化されたカテゴリ判別

どうやら、ブログラム言語よりになったらしいです。

ANDは「hogeかつhoge2を含む」というどちらのカテゴリにも属する場合。 ORは「hogeかhoge2」というどちらかの記事であれば表示させるようです。

んー。これでしばらくドツボでした。マニュアルにも書いていないので結構穴かも。お気をつけあそばせ。